Le Projet Milieu Intérieur

Qu'est-ce que le projet Milieu Intérieur ?

Le projet Milieu Intérieur (MI) est une ambitieuse étude de population coordonnée par le professeur Lluis Quintana-Murci et le docteur Darragh Duffy à l'Institut Pasteur de Paris. L'objectif est de disséquer l'interaction entre la génétique et l'environnement et leur impact sur le système immunitaire. Le projet établi par les professeurs Matthew Albert et Lluis Quintana-Murci fait partie d'une initiative plus large du gouvernement français appelée Investissement d'Avenir - Laboratoire d'Excellence (LabEx). Cliquez ici pour accéder à la liste des publications de l'IM.
Alors que le système immunitaire est extrêmement complexe et que l'on sait que les réponses varient selon les individus et les populations, les pratiques médicales et les politiques de santé publique restent fondées sur un modèle unique de soins aux patients et de développement de médicaments. Le projet Milieu Intérieur a été lancé spécifiquement pour remédier à cette divergence. Les objectifs spécifiques du projet Milieu Intérieur sont de :
(i) définir la variabilité naturelle de la réponse immunitaire humaine,
(ii) évaluer comment cette variation est contrôlée génétiquement, épigénétiquement ou environnementalement,
(iii) comprendre comment cette variation génétique/phénotypique peut expliquer les différences de susceptibilité à l'infection, au traitement thérapeutique ou à la réponse au vaccin, et
(iv) vérifier la variation et le rôle du microbiote dans la régulation des programmes immunitaires.

Cette projet a permis de mieux comprendre les facteurs génétiques et non génétiques à l'origine des variations de la réponse immunitaire, ainsi que la mise en banque de données biologiques et la production de données. En outre, il a contribué à l'enseignement, à la formation et à la création d'une communauté structurée de chercheurs transdisciplinaires. Certaines des principales réalisations sont présentées ci-dessous.

• Mise en place d'une cohorte humaine

• Définition de signatures immunitaires protéiques et transcriptionnelles.

• Caractérisation génétique de la cohorte humaine

• Déterminants génétiques, intrinsèques et environnementaux de la variation de la réponse immunitaire.

• Caractérisation du microbiote

• Un dépôt d'échantillons et un entrepôt de données

• Application du concept MI à des contextes pathologiques

(Illustration - Échantillons et données recueillis auprès de la cohorte MI et analyse effectuée)

L'avenir et le présent

Évaluation à 10 ans

Nous sommes en train de mettre en place une évaluation de suivi de 10 ans de notre cohorte. Compte tenu de la richesse des ensembles de données disponibles et de l'expérience que nous avons acquise en tant que consortium multidisciplinaire, nous sommes bien placés pour évaluer la variabilité temporelle au sein de la population de donneurs "sains".

Nous recontacterons les donneurs avec un questionnaire et une invitation à participer à une nouvelle étude clinique. Le questionnaire sera similaire à celui de l'étude initiale pour recueillir des informations sur les antécédents médicaux, le mode de vie, les cofacteurs alimentaires et environnementaux, mais il sera modifié et adapté en fonction de l'expérience acquise depuis l'étude initiale. Nous nous concentrerons sur les questions liées au vieillissement, aux changements épigénétiques, à la stabilité du microbiome et aux réponses immunitaires induites par les facteurs clés. Nous accorderons une attention particulière aux facteurs qui caractérisent les individus qui ne répondent plus à nos critères initiaux de "donneur sain" (par exemple, obésité, hypertension ou autres affections courantes) et évaluerons l'impact de ces changements sur la variation de la réponse immunitaire.

Application des concepts de l'IM à d'autres groupes d'âge

Cohorte néonatale (Karolinska Institutet)

Nous évaluerons la réactivité fonctionnelle des nouveau-nés à différents moments de leur vie et la comparerons aux réponses des adultes profilées dans la cohorte MI.

Cohorte pédiatrique (Institut Imagine)

Nous analyserons la réponse immunitaire d'une cohorte de 200 enfants en bonne santé dont l'âge varie entre 5 et 16 ans.

Cohorte âgée (TILDA, Trinity College Dublin)

Nous étendrons l'approche de l'IM à une étude longitudinale existante d'une cohorte âgée ; l'étude longitudinale irlandaise sur le vieillissement (TILDA). Nous prévoyons d'inclure l'analyse immunophénotypique de l'IM en nous concentrant sur les populations âgées recrutées dans cette étude (500 individus âgés de plus de 75 ans) afin de mieux comprendre les questions liées à l'inflammation et au vieillissement et la façon dont l'inflammation contribue au développement d'autres conditions médicales liées à l'âge.

Application des concepts de l'IM à d'autres populations

Dans la littérature médicale, les études axées sur les populations d'origine européenne sont fortement biaisées. Afin d'étendre la portée géographique et la diversité ethnique de l'IM, nous avons lancé le Healthy Human Global Project (HHGP), qui tire parti du réseau international IP pour établir des projets de collaboration en Afrique et en Asie, en complément de l'étude existante sur une population européenne.

Sénégal

Le premier site du HHGP est à l'Institut Pasteur de Dakar, où nous avons mené une étude pilote sur 48 donneurs stratifiés par sexe dans deux villages (Dielmo et Ndiop). Nous sommes en train d'analyser les données.

Hong Kong

Le deuxième site du HHGP se trouve à l'Institut Pasteur Hong Kong (IP HK) et à la faculté de médecine Li Ka Shing de l'Université de Hong Kong (HKU). En collaboration avec la Hong Kong Science and Technology Parks Corporation (HKSTP), un nouveau centre de recherche interdisciplinaire en immunologie, infection et médecine personnalisée a été créé.